Der Võhandu ist Estlands längster Fluss (179,4 km). Der Võhandu beginnt im östlichen Teil der Höhen von Otepää, fließt durch die Seen des Võru-Tals, durch das Plateau von Nordostestland und der Peipus-Region und mündet dann nach 179,4 Kilometern in den See Lämmijärve (im Kreis Põlvamaa in Võõpsu). Im Oberlauf trägt der Fluss den Namen Pühajõgi oder Voo, ab Võru heißt er dann Võhandu. Im Mittellauf (in Paidra) verengt sich der Fluss erneut und fließt in einem gewundenen, von hohen Sandsteinfelsen und Höhlen umgebenen Bett.